Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cass4Q08EC4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cass4Q08EC4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms