Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gata4Q08369 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gata4Q08369 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms