Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cntn3Q07409 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cntn3Q07409 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms