Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Siah2Q06986 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Siah2Q06986 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms