Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Atf4Q06507 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atf4Q06507 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms