Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Caprin2Q05A80 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Caprin2Q05A80 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms