Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sox13Q04891 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms