Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox8Q04886 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sox8Q04886 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms