Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top1Q04750 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top1Q04750 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Top1Q04750 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top1Q04750 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top1Q04750 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top1Q04750 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top1Q04750 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Top1Q04750 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms