Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mmp11Q02853 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mmp11Q02853 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms