Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gjb5Q02739 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms