Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snai1Q02085 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snai1Q02085 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms