Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VcpQ01853 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VcpQ01853 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VcpQ01853 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VcpQ01853 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VcpQ01853 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VcpQ01853 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VcpQ01853 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VcpQ01853 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VcpQ01853 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VcpQ01853 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VcpQ01853 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms