Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gbp1Q01514 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms