Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Col1a2Q01149 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Col1a2Q01149 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms