Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gjb2Q00977 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb2Q00977 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms