Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoa1Q00623 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Apoa1Q00623 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms