Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gabpb1Q00420 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gabpb1Q00420 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms