Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds1P98191 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds1P98191 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds1P98191 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds1P98191 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cds1P98191 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cds1P98191 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds1P98191 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds1P98191 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds1P98191 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds1P98191 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cds1P98191 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms