Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps45P97390 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps45P97390 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps45P97390 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps45P97390 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps45P97390 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps45P97390 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps45P97390 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps45P97390 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps45P97390 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps45P97390 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps45P97390 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms