Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gbx1P82976 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms