Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx2P80206 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx2P80206 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx2P80206 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otx2P80206 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otx2P80206 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx2P80206 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx2P80206 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx2P80206 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Otx2P80206 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Otx2P80206 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms