Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad1P70340 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad1P70340 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad1P70340 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad1P70340 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad1P70340 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad1P70340 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad1P70340 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad1P70340 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad1P70340 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad1P70340 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms