Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf5P70191 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf5P70191 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf5P70191 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf5P70191 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf5P70191 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Traf5P70191 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Traf5P70191 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf5P70191 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Traf5P70191 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms