Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Snrpd1P62315 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Snrpd1P62315 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms