Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps11P62281 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rps11P62281 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rps11P62281 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps11P62281 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps11P62281 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps11P62281 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps11P62281 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rps11P62281 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps11P62281 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps11P62281 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rps11P62281 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms