Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tspan5P62080 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms