Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copz1P61924 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copz1P61924 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Copz1P61924 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copz1P61924 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copz1P61924 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copz1P61924 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copz1P61924 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copz1P61924 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copz1P61924 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copz1P61924 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copz1P61924 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Copz1P61924 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms