Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rin3P59729 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rin3P59729 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rin3P59729 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rin3P59729 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rin3P59729 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rin3P59729 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rin3P59729 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rin3P59729 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rin3P59729 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rin3P59729 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rin3P59729 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rin3P59729 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms