Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpaP58389 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpaP58389 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpaP58389 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PtpaP58389 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtpaP58389 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PtpaP58389 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpaP58389 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpaP58389 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpaP58389 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpaP58389 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpaP58389 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpaP58389 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpaP58389 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpaP58389 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpaP58389 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpaP58389 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpaP58389 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpaP58389 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpaP58389 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpaP58389 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpaP58389 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpaP58389 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PtpaP58389 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms