Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Dpf3P58269 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms