Protein–RNA interactions for Protein: P56393

Cox7b, Cytochrome c oxidase subunit 7B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox7bP56393 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cox7bP56393 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cox7bP56393 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms