Protein–RNA interactions for Protein: P55288

Cdh11, Cadherin-11, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh11P55288 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdh11P55288 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms