Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtskP55097 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtskP55097 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtskP55097 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtskP55097 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtskP55097 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtskP55097 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtskP55097 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtskP55097 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtskP55097 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CtskP55097 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtskP55097 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtskP55097 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtskP55097 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtskP55097 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtskP55097 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtskP55097 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CtskP55097 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CtskP55097 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtskP55097 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtskP55097 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtskP55097 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtskP55097 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtskP55097 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtskP55097 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CtskP55097 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtskP55097 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtskP55097 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtskP55097 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtskP55097 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtskP55097 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtskP55097 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtskP55097 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtskP55097 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CtskP55097 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CtskP55097 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtskP55097 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtskP55097 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtskP55097 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtskP55097 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CtskP55097 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtskP55097 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtskP55097 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtskP55097 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CtskP55097 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtskP55097 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtskP55097 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtskP55097 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtskP55097 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtskP55097 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtskP55097 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtskP55097 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CtskP55097 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CtskP55097 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CtskP55097 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CtskP55097 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtskP55097 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtskP55097 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtskP55097 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtskP55097 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtskP55097 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtskP55097 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtskP55097 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtskP55097 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtskP55097 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtskP55097 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtskP55097 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtskP55097 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CtskP55097 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtskP55097 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtskP55097 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtskP55097 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms