Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PltpP55065 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PltpP55065 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PltpP55065 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PltpP55065 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PltpP55065 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PltpP55065 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PltpP55065 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PltpP55065 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PltpP55065 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PltpP55065 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PltpP55065 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PltpP55065 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PltpP55065 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PltpP55065 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PltpP55065 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PltpP55065 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PltpP55065 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PltpP55065 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PltpP55065 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PltpP55065 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PltpP55065 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PltpP55065 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PltpP55065 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PltpP55065 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PltpP55065 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PltpP55065 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PltpP55065 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PltpP55065 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PltpP55065 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PltpP55065 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PltpP55065 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PltpP55065 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PltpP55065 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PltpP55065 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PltpP55065 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PltpP55065 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PltpP55065 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PltpP55065 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PltpP55065 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PltpP55065 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PltpP55065 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PltpP55065 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PltpP55065 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PltpP55065 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PltpP55065 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PltpP55065 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PltpP55065 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PltpP55065 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PltpP55065 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PltpP55065 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PltpP55065 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PltpP55065 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PltpP55065 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PltpP55065 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PltpP55065 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PltpP55065 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PltpP55065 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PltpP55065 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PltpP55065 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PltpP55065 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PltpP55065 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PltpP55065 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PltpP55065 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PltpP55065 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PltpP55065 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PltpP55065 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PltpP55065 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PltpP55065 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PltpP55065 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PltpP55065 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PltpP55065 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PltpP55065 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PltpP55065 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PltpP55065 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PltpP55065 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PltpP55065 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PltpP55065 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PltpP55065 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PltpP55065 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PltpP55065 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PltpP55065 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PltpP55065 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PltpP55065 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PltpP55065 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PltpP55065 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PltpP55065 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PltpP55065 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PltpP55065 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PltpP55065 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PltpP55065 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PltpP55065 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PltpP55065 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PltpP55065 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PltpP55065 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PltpP55065 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PltpP55065 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PltpP55065 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PltpP55065 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PltpP55065 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms