Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acod1P54987 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acod1P54987 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acod1P54987 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Acod1P54987 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acod1P54987 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acod1P54987 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acod1P54987 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Acod1P54987 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms