Protein–RNA interactions for Protein: P54130

Fgf9, Fibroblast growth factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf9P54130 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fgf9P54130 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fgf9P54130 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms