Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Map3k1P53349 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Map3k1P53349 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Map3k1P53349 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms