Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccr4P51680 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccr4P51680 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.7 ms