Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Opn1swP51491 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Opn1swP51491 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms