Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd7P50283 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd7P50283 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd7P50283 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd7P50283 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd7P50283 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd7P50283 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd7P50283 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd7P50283 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd7P50283 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd7P50283 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd7P50283 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd7P50283 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd7P50283 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd7P50283 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd7P50283 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd7P50283 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd7P50283 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd7P50283 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd7P50283 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd7P50283 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd7P50283 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd7P50283 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd7P50283 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd7P50283 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd7P50283 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd7P50283 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd7P50283 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd7P50283 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd7P50283 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd7P50283 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd7P50283 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cd7P50283 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd7P50283 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd7P50283 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd7P50283 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd7P50283 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd7P50283 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd7P50283 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd7P50283 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms