Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cxcl5P50228 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cxcl5P50228 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms