Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cav1P49817 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cav1P49817 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cav1P49817 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cav1P49817 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cav1P49817 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cav1P49817 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cav1P49817 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cav1P49817 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms