Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tmod1P49813 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tmod1P49813 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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