Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb42P49222 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb42P49222 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb42P49222 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb42P49222 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb42P49222 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb42P49222 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb42P49222 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb42P49222 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Epb42P49222 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Epb42P49222 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms