Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ptx3P48759 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptx3P48759 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms