Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Rpl5P47962 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl5P47962 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl5P47962 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl5P47962 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl5P47962 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl5P47962 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl5P47962 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl5P47962 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl5P47962 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl5P47962 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl5P47962 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl5P47962 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl5P47962 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl5P47962 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl5P47962 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpl5P47962 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl5P47962 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl5P47962 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl5P47962 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl5P47962 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl5P47962 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl5P47962 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl5P47962 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl5P47962 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl5P47962 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl5P47962 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl5P47962 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpl5P47962 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms