Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax7P47239 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pax7P47239 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax7P47239 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax7P47239 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax7P47239 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax7P47239 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax7P47239 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax7P47239 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms