Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic1P46684 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Zic1P46684 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Zic1P46684 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Zic1P46684 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zic1P46684 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zic1P46684 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zic1P46684 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Zic1P46684 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Zic1P46684 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zic1P46684 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zic1P46684 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zic1P46684 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zic1P46684 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Zic1P46684 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms