Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab11bP46638 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab11bP46638 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms